政学士俞大猷、潘应龙、胡如恭，江苏巡抚杨令德、安徽巡抚胡宗璞、江苏布政使李鄂、安徽布政使张嗣迪等官员陪同下，身穿祭服，进凤阳皇陵祭拜。
一行人由北向南，先进土城正红门。
皇陵分三层，一层一城。
最外面一层是土城，中间是砖城，里面是皇城。
进了土城正红门，沿着红桥进棂星门、砖城明楼，再沿着神道过御桥，入皇城金门，来到皇城正殿，也叫祭殿和享殿。
共有九间，采用丹色三级黄琉璃瓦，青碧绘彩装饰。东西两侧还有各十一间的庑房。
中间大殿供奉着大明仁祖淳皇帝和淳皇后（朱元璋父母亲）的神主牌位，两边还有配享的南昌王朱兴隆、盱眙王朱兴盛、临淮王朱兴祖（朱元璋大哥、二哥和三哥）的神主牌位。
祭拜仪式就在大殿举行。
上三牲祭品，赞官念祭文。
祭文自然是张四维捉刀写的。
然后朱翊钧带着宋贵妃、皇子皇女在殿内，徐贞明带着文武官员在殿外平台上，对着神主牌位五拜三叩首。
接着朱翊钧、宋贵妃、皇子皇女在左偏殿换装，官员在右偏殿换装，把祭服换成日常服，或资服或工装，然后朱翊钧带着宋贵妃、朱轩妮等人在陵丘翌圣山左边，徐贞明等人在右边，每人种下一棵不大的柏树。
“松柏成林，遗荫后嗣。”
种完树后，朱翊钧带着宋贵妃和皇子皇女们，在陵丘前以家礼祭拜了一番。
礼成！
朱翊钧让宋贵妃带着皇子皇女自去偏殿休息，自己带着部分随从围着皇陵转了一圈。
皇陵有两百多年历史，年代久远，许多地方有破烂迹象。
成化二十三年，成化帝进行了一次大规模的重修。
此后，嘉靖年间世宗皇帝也进行了四次修缮工程。
朱翊钧即位后，皇室不差钱，万历三年进行皇陵建成以来最大规模的重修，直接上砖石和钢筋混泥土。
一圈转下来，果真到处是焕然一新，钱没白花。
由于万历元年停止招募阉人，驻扎这里的净军日渐稀少。中都留守府上疏，请移百姓居住，进行日常维护。